✅作者简介热爱科研的Matlab仿真开发者擅长毕业设计辅导、数学建模、数据处理、建模仿真、程序设计、完整代码获取、论文复现及科研仿真。 往期回顾关注个人主页Matlab科研工作室 关注我领取海量matlab电子书和数学建模资料个人信条做科研博学之、审问之、慎思之、明辨之、笃行之是为博学慎思明辨笃行。 内容介绍蛋白质结构预测是计算分子生物学领域的核心课题。本文采用AB非晶格模型将传统的蛋白质结构预测方案转化为数值优化问题。我们提出了一种平衡演化人工蜂群BE-ABC算法来解决这一问题旨在为给定蛋白质序列寻找具有最小自由能值的结构。该算法通过在优化过程中利用收敛信息动态调整搜索强度来实现这一目标。此外BE-ABC算法还引入了整体退化机制以防止过早收敛。基于著名的人工斐波那契序列集及蛋白质数据库中的多个真实序列我们开展了全面的模拟实验对比了BE-ABC算法与其他算法的性能表现。数值结果表明BE-ABC算法不仅能够超越众多前沿方法还可有效应用于蛋白质结构优化领域。⛳️ 运行结果 部分代码function unfreezeColors(h)% unfreezeColors Restore colors of a plot to original indexed color. (v2.3)%% Useful if you want to apply a new colormap to plots whose% colors were previously frozen with freezeColors.%% Usage:% unfreezeColors unfreezes all objects in current axis,% unfreezeColors(axh) same, but works on axis axh. axh can be vector.% unfreezeColors(figh) same, but for all objects in figure figh.%% Has no effect on objects on which freezeColors was not already called.% (Note: if colorbars were frozen using cbfreeze, use cbfreeze(off) to% unfreeze them. See freezeColors for information on cbfreeze.)%%% See also freezeColors, freezeColors_pub.html, cbfreeze.%%% John Iversen (iversennsi.edu) 3/23/05%% Changes:% JRI 9/1/06 now restores any object with frozen CData;% can unfreeze an entire figure at once.% JRI 4/7/10 Change documentation for colorbars% Free for all uses, but please retain the following:%% Original Author:% John Iversen, 2005-10% john_iversenpost.harvard.eduerror(nargchk(0,1,nargin,struct))appdatacode JRI__freezeColorsData;fault: operate on gcaif nargin 1,h gca;endif ~ishandle(h),error(JRI:unfreezeColors:invalidHandle,...The argument must be a valid graphics handle to a figure or axis)end%if h is a figure, loop on its axesif strcmp(get(h,type),figure),h get(h,children);endfor h1 h, %loop on axes%process all children, acting only on those with saved CData% ( in appdata JRI__freezeColorsData)ch findobj(h1);for hh ch,%some object handles may be invalidated when their parent changes% (e.g. restoring colors of a scattergroup unfortunately changes% the handles of all its children). So, first check to make sure% its a valid handleif ishandle(hh)if isappdata(hh,appdatacode),ad getappdata(hh,appdatacode);%get oroginal cdata%patches have to be handled separately (see note in freezeColors)if ~strcmp(get(hh,type),patch),cdata get(hh,CData);elsecdata get(hh,faceVertexCData);cdata permute(cdata,[1 3 2]);endindexed ad{1};scalemode ad{2};%size consistency checkif all(size(indexed) size(cdata(:,:,1))),%ok, restore indexed cdataif ~strcmp(get(hh,type),patch),set(hh,CData,indexed);elseset(hh,faceVertexCData,indexed);end%restore cdatamapping, if neededg get(hh);if isfield(g,CDataMapping),set(hh,CDataMapping,scalemode);end%clear appdatarmappdata(hh,appdatacode)elsewarning(JRI:unfreezeColors:internalCdataInconsistency,...[Could not restore indexed data: it is the wrong size. ...Were the axis contents changed since the call to freezeColors?])endend %test if has our appdataend %test ishandleend %loop on childrenend %loop on axes 参考文献A balance-evolution artificial bee colony algorithm for protein structure optimization based on a three-dimensional AB off-lattice model更多创新智能优化算法模型和应用场景可扫描关注机器学习/深度学习类BP、SVM、RVM、DBN、LSSVM、ELM、KELM、HKELM、DELM、RELM、DHKELM、RF、SAE、LSTM、BiLSTM、GRU、BiGRU、PNN、CNN、XGBoost、LightGBM、TCN、BiTCN、ESN、Transformer、模糊小波神经网络、宽度学习等等均可~方向涵盖风电预测、光伏预测、电池寿命预测、辐射源识别、交通流预测、负荷预测、股价预测、PM2.5浓度预测、电池健康状态预测、用电量预测、水体光学参数反演、NLOS信号识别、地铁停车精准预测、变压器故障诊断组合预测类CNN/TCN/BiTCN/DBN/Transformer/Adaboost结合SVM、RVM、ELM、LSTM、BiLSTM、GRU、BiGRU、Attention机制类等均可可任意搭配非常新颖~分解类EMD、EEMD、VMD、REMD、FEEMD、TVFEMD、CEEMDAN、ICEEMDAN、SVMD、FMD、JMD等分解模型均可~路径规划类旅行商问题TSP、车辆路径问题VRP、MVRP、CVRP、VRPTW等、无人机三维路径规划、无人机协同、无人机编队、机器人路径规划、栅格地图路径规划、多式联运运输问题、 充电车辆路径规划EVRP、 双层车辆路径规划2E-VRP、 油电混合车辆路径规划、 船舶航迹规划、 全路径规划规划、 仓储巡逻、公交车时间调度、水库调度优化、多式联运优化等等~小众优化类生产调度、经济调度、装配线调度、充电优化、车间调度、发车优化、水库调度、三维装箱、物流选址、货位优化、公交排班优化、充电桩布局优化、车间布局优化、集装箱船配载优化、水泵组合优化、解医疗资源分配优化、设施布局优化、可视域基站和无人机选址优化、背包问题、 风电场布局、时隙分配优化、 最佳分布式发电单元分配、多阶段管道维修、 工厂-中心-需求点三级选址问题、 应急生活物质配送中心选址、 基站选址、 道路灯柱布置、 枢纽节点部署、 输电线路台风监测装置、 集装箱调度、 机组优化、 投资优化组合、云服务器组合优化、 天线线性阵列分布优化、CVRP问题、VRPPD问题、多中心VRP问题、多层网络的VRP问题、多中心多车型的VRP问题、 动态VRP问题、双层车辆路径规划2E-VRP、充电车辆路径规划EVRP、油电混合车辆路径规划、混合流水车间问题、 订单拆分调度问题、 公交车的调度排班优化问题、航班摆渡车辆调度问题、选址路径规划问题、港口调度、港口岸桥调度、停机位分配、机场航班调度、泄漏源定位、冷链、时间窗、多车场等、选址优化、港口岸桥调度优化、交通阻抗、重分配、停机位分配、机场航班调度、通信上传下载分配优化、微电网优化、无功优化、配电网重构、储能配置、有序充电、MPPT优化、家庭用电、电/冷/热负荷预测、电力设备故障诊断、电池管理系统BMSSOC/SOH估算粒子滤波/卡尔曼滤波、 多目标优化在电力系统调度中的应用、光伏MPPT控制算法改进扰动观察法/电导增量法、电动汽车充放电优化、微电网日前日内优化、储能优化、家庭用电优化、供应链优化\智能电网分布式能源经济优化调度虚拟电厂能源消纳风光出力控制策略多目标优化博弈能源调度鲁棒优化等等均可~ 无人机应用方面无人机路径规划、无人机控制、无人机编队、无人机协同、无人机任务分配、无人机安全通信轨迹在线优化、车辆协同无人机路径规划通信方面传感器部署优化、通信协议优化、路由优化、目标定位优化、Dv-Hop定位优化、Leach协议优化、WSN覆盖优化、组播优化、RSSI定位优化、水声通信、通信上传下载分配信号处理方面信号识别、信号加密、信号去噪、信号增强、雷达信号处理、信号水印嵌入提取、肌电信号、脑电信号、信号配时优化、心电信号、DOA估计、编码译码、变分模态分解、管道泄漏、滤波器、数字信号处理传输分析去噪、数字信号调制、误码率、信号估计、DTMF、信号检测电力系统方面 微电网优化、无功优化、配电网重构、储能配置、有序充电、MPPT优化、家庭用电、电/冷/热负荷预测、电力设备故障诊断、电池管理系统BMSSOC/SOH估算粒子滤波/卡尔曼滤波、 多目标优化在电力系统调度中的应用、光伏MPPT控制算法改进扰动观察法/电导增量法、电动汽车充放电优化、微电网日前日内优化、储能优化、家庭用电优化、供应链优化\智能电网分布式能源经济优化调度虚拟电厂能源消纳风光出力控制策略多目标优化博弈能源调度鲁棒优化原创改进优化算法适合需要创新的同学原创改进2025年的波动光学优化算法WOO以及三国优化算法TKOA、白鲸优化算法BWO等任意优化算法均可保证测试函数效果一般可直接核心
【优化求解】基于三维AB离格模型的平衡进化人工蜂群算法用于蛋白质结构优化附matlab代码
发布时间：2026/6/6 1:02:51
✅作者简介热爱科研的Matlab仿真开发者擅长毕业设计辅导、数学建模、数据处理、建模仿真、程序设计、完整代码获取、论文复现及科研仿真。 往期回顾关注个人主页Matlab科研工作室 关注我领取海量matlab电子书和数学建模资料个人信条做科研博学之、审问之、慎思之、明辨之、笃行之是为博学慎思明辨笃行。 内容介绍蛋白质结构预测是计算分子生物学领域的核心课题。本文采用AB非晶格模型将传统的蛋白质结构预测方案转化为数值优化问题。我们提出了一种平衡演化人工蜂群BE-ABC算法来解决这一问题旨在为给定蛋白质序列寻找具有最小自由能值的结构。该算法通过在优化过程中利用收敛信息动态调整搜索强度来实现这一目标。此外BE-ABC算法还引入了整体退化机制以防止过早收敛。基于著名的人工斐波那契序列集及蛋白质数据库中的多个真实序列我们开展了全面的模拟实验对比了BE-ABC算法与其他算法的性能表现。数值结果表明BE-ABC算法不仅能够超越众多前沿方法还可有效应用于蛋白质结构优化领域。⛳️ 运行结果 部分代码function unfreezeColors(h)% unfreezeColors Restore colors of a plot to original indexed color. (v2.3)%% Useful if you want to apply a new colormap to plots whose% colors were previously frozen with freezeColors.%% Usage:% unfreezeColors unfreezes all objects in current axis,% unfreezeColors(axh) same, but works on axis axh. axh can be vector.% unfreezeColors(figh) same, but for all objects in figure figh.%% Has no effect on objects on which freezeColors was not already called.% (Note: if colorbars were frozen using cbfreeze, use cbfreeze(off) to% unfreeze them. See freezeColors for information on cbfreeze.)%%% See also freezeColors, freezeColors_pub.html, cbfreeze.%%% John Iversen (iversennsi.edu) 3/23/05%% Changes:% JRI 9/1/06 now restores any object with frozen CData;% can unfreeze an entire figure at once.% JRI 4/7/10 Change documentation for colorbars% Free for all uses, but please retain the following:%% Original Author:% John Iversen, 2005-10% john_iversenpost.harvard.eduerror(nargchk(0,1,nargin,struct))appdatacode JRI__freezeColorsData;fault: operate on gcaif nargin 1,h gca;endif ~ishandle(h),error(JRI:unfreezeColors:invalidHandle,...The argument must be a valid graphics handle to a figure or axis)end%if h is a figure, loop on its axesif strcmp(get(h,type),figure),h get(h,children);endfor h1 h, %loop on axes%process all children, acting only on those with saved CData% ( in appdata JRI__freezeColorsData)ch findobj(h1);for hh ch,%some object handles may be invalidated when their parent changes% (e.g. restoring colors of a scattergroup unfortunately changes% the handles of all its children). So, first check to make sure% its a valid handleif ishandle(hh)if isappdata(hh,appdatacode),ad getappdata(hh,appdatacode);%get oroginal cdata%patches have to be handled separately (see note in freezeColors)if ~strcmp(get(hh,type),patch),cdata get(hh,CData);elsecdata get(hh,faceVertexCData);cdata permute(cdata,[1 3 2]);endindexed ad{1};scalemode ad{2};%size consistency checkif all(size(indexed) size(cdata(:,:,1))),%ok, restore indexed cdataif ~strcmp(get(hh,type),patch),set(hh,CData,indexed);elseset(hh,faceVertexCData,indexed);end%restore cdatamapping, if neededg get(hh);if isfield(g,CDataMapping),set(hh,CDataMapping,scalemode);end%clear appdatarmappdata(hh,appdatacode)elsewarning(JRI:unfreezeColors:internalCdataInconsistency,...[Could not restore indexed data: it is the wrong size. ...Were the axis contents changed since the call to freezeColors?])endend %test if has our appdataend %test ishandleend %loop on childrenend %loop on axes 参考文献A balance-evolution artificial bee colony algorithm for protein structure optimization based on a three-dimensional AB off-lattice model更多创新智能优化算法模型和应用场景可扫描关注机器学习/深度学习类BP、SVM、RVM、DBN、LSSVM、ELM、KELM、HKELM、DELM、RELM、DHKELM、RF、SAE、LSTM、BiLSTM、GRU、BiGRU、PNN、CNN、XGBoost、LightGBM、TCN、BiTCN、ESN、Transformer、模糊小波神经网络、宽度学习等等均可~方向涵盖风电预测、光伏预测、电池寿命预测、辐射源识别、交通流预测、负荷预测、股价预测、PM2.5浓度预测、电池健康状态预测、用电量预测、水体光学参数反演、NLOS信号识别、地铁停车精准预测、变压器故障诊断组合预测类CNN/TCN/BiTCN/DBN/Transformer/Adaboost结合SVM、RVM、ELM、LSTM、BiLSTM、GRU、BiGRU、Attention机制类等均可可任意搭配非常新颖~分解类EMD、EEMD、VMD、REMD、FEEMD、TVFEMD、CEEMDAN、ICEEMDAN、SVMD、FMD、JMD等分解模型均可~路径规划类旅行商问题TSP、车辆路径问题VRP、MVRP、CVRP、VRPTW等、无人机三维路径规划、无人机协同、无人机编队、机器人路径规划、栅格地图路径规划、多式联运运输问题、 充电车辆路径规划EVRP、 双层车辆路径规划2E-VRP、 油电混合车辆路径规划、 船舶航迹规划、 全路径规划规划、 仓储巡逻、公交车时间调度、水库调度优化、多式联运优化等等~小众优化类生产调度、经济调度、装配线调度、充电优化、车间调度、发车优化、水库调度、三维装箱、物流选址、货位优化、公交排班优化、充电桩布局优化、车间布局优化、集装箱船配载优化、水泵组合优化、解医疗资源分配优化、设施布局优化、可视域基站和无人机选址优化、背包问题、 风电场布局、时隙分配优化、 最佳分布式发电单元分配、多阶段管道维修、 工厂-中心-需求点三级选址问题、 应急生活物质配送中心选址、 基站选址、 道路灯柱布置、 枢纽节点部署、 输电线路台风监测装置、 集装箱调度、 机组优化、 投资优化组合、云服务器组合优化、 天线线性阵列分布优化、CVRP问题、VRPPD问题、多中心VRP问题、多层网络的VRP问题、多中心多车型的VRP问题、 动态VRP问题、双层车辆路径规划2E-VRP、充电车辆路径规划EVRP、油电混合车辆路径规划、混合流水车间问题、 订单拆分调度问题、 公交车的调度排班优化问题、航班摆渡车辆调度问题、选址路径规划问题、港口调度、港口岸桥调度、停机位分配、机场航班调度、泄漏源定位、冷链、时间窗、多车场等、选址优化、港口岸桥调度优化、交通阻抗、重分配、停机位分配、机场航班调度、通信上传下载分配优化、微电网优化、无功优化、配电网重构、储能配置、有序充电、MPPT优化、家庭用电、电/冷/热负荷预测、电力设备故障诊断、电池管理系统BMSSOC/SOH估算粒子滤波/卡尔曼滤波、 多目标优化在电力系统调度中的应用、光伏MPPT控制算法改进扰动观察法/电导增量法、电动汽车充放电优化、微电网日前日内优化、储能优化、家庭用电优化、供应链优化\智能电网分布式能源经济优化调度虚拟电厂能源消纳风光出力控制策略多目标优化博弈能源调度鲁棒优化等等均可~ 无人机应用方面无人机路径规划、无人机控制、无人机编队、无人机协同、无人机任务分配、无人机安全通信轨迹在线优化、车辆协同无人机路径规划通信方面传感器部署优化、通信协议优化、路由优化、目标定位优化、Dv-Hop定位优化、Leach协议优化、WSN覆盖优化、组播优化、RSSI定位优化、水声通信、通信上传下载分配信号处理方面信号识别、信号加密、信号去噪、信号增强、雷达信号处理、信号水印嵌入提取、肌电信号、脑电信号、信号配时优化、心电信号、DOA估计、编码译码、变分模态分解、管道泄漏、滤波器、数字信号处理传输分析去噪、数字信号调制、误码率、信号估计、DTMF、信号检测电力系统方面 微电网优化、无功优化、配电网重构、储能配置、有序充电、MPPT优化、家庭用电、电/冷/热负荷预测、电力设备故障诊断、电池管理系统BMSSOC/SOH估算粒子滤波/卡尔曼滤波、 多目标优化在电力系统调度中的应用、光伏MPPT控制算法改进扰动观察法/电导增量法、电动汽车充放电优化、微电网日前日内优化、储能优化、家庭用电优化、供应链优化\智能电网分布式能源经济优化调度虚拟电厂能源消纳风光出力控制策略多目标优化博弈能源调度鲁棒优化原创改进优化算法适合需要创新的同学原创改进2025年的波动光学优化算法WOO以及三国优化算法TKOA、白鲸优化算法BWO等任意优化算法均可保证测试函数效果一般可直接核心
