【科研绘图系列】Cell metabolism复现 | PCoA 个体椭圆轨迹图

发布时间:2026/6/1 9:08:42

【科研绘图系列】Cell metabolism复现 | PCoA 个体椭圆轨迹图 文章目录介绍文献信息原图解读图形元素复现思路数据下载加载数据构造模拟 PCoA 数据计算受试者椭圆绘制同一受试者的点、线和椭圆绘制 Figure 3A绘制 Figure 3E导出图片一键运行介绍在肠道菌群干预研究中,一个重要问题是:饮食干预是否会让受试者整体菌群结构发生大幅偏移,还是每个人仍然保持稳定而独特的微生物组特征?本教程复现的图来自Bread Affects Clinical Parameters and Induces Gut Microbiome-Associated Personal Glycemic Responses的 Figure 3A 和 Figure 3E。原图用 PCoA 坐标、受试者内椭圆和多时间点样本展示了一个核心结果:同一个人的多次粪便样本在二维空间中聚集,而不同个体之间的重叠较少,说明整体 gut microbiota species composition 在研究期间相对稳定。文献信息Korem, T. et al.Bread Affects Clinical Parameters and Induces Gut Microbiome-Associated Personal Glycemic Responses. Cell Metabolism (2017). Figure 3A and 3E.原图解读Figure 3 的标题为Overall Gut Microbiota Species Composition Remai

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